在SNP的檢測方法中,通過PCR擴(kuò)增后直接測序是十分有效的方法,被公認(rèn)為是SNP檢測的“金標(biāo)準(zhǔn)”。在測序峰圖中,純合型SNP的測序峰為單一峰型,而雜合型的為雙峰,所以非常容易區(qū)分。采用這種方法,SNP檢出率接近100%。
技術(shù)簡介
SNP( Single Nucleotide Polymorphism),即單核苷酸多態(tài)性,是指在基因組上單個核苷酸的變異,包括轉(zhuǎn)換、顛換、插入和缺失,形成的遺傳標(biāo)記。SNP所表現(xiàn)的多態(tài)性只涉及到單個堿基的變異,這種變異可由單個堿基的轉(zhuǎn)換(transition)或顛換(transversion)所引起,也可由堿基的插入或缺失所致。其數(shù)量很多,多態(tài)性豐富,有些SNP位點直接影響基因功能,從而導(dǎo)致生物性狀改變。其中CG序列上出現(xiàn)的SNP最為頻繁,而且多是C轉(zhuǎn)換為T,原因是CG中的C常因為甲基化自發(fā)地脫氨基后即成為胸腺嘧啶T。
一般來說,一個SNP位點只有兩種等位基因,因此又叫雙等位基因。SNP在人基因組中的發(fā)生頻率比較高,大約平均每1000個堿基中就有一個多態(tài)位點,有些SNP位點還會影響基因的功能,從而導(dǎo)致生物性狀改變甚至致病。單核苷酸多態(tài)性是研究人類家族和動植物品系遺傳變異的重要依據(jù),因此被廣泛用于群體遺傳學(xué)研究(如生物的起源、進(jìn)化及遷移等方面)和疾病相關(guān)基因的研究,在藥物基因組學(xué)、診斷學(xué)和生物醫(yī)學(xué)研究中起重要作用。
適用范圍
1. DNA序列的變化將影響不同人群疾病的發(fā)生和演變,以及對病原體,化學(xué)試劑,藥品及疫苗的病理反應(yīng)。 因此SNPs被認(rèn)為是在未來實現(xiàn)個性化醫(yī)療的關(guān)鍵環(huán)節(jié)。 SNP方面的研究在農(nóng)作物和畜牧業(yè)項目上也很重要。 目前SNP檢測已廣泛應(yīng)用于群體遺傳學(xué)和疾病相關(guān)基因的研究,在藥物基因組學(xué)、診斷學(xué)和生物醫(yī)學(xué)研究中發(fā)揮著重要作用。
2. 采用直接測序法,本方法適合于樣品數(shù)和檢測位點都不多的情況。
服務(wù)內(nèi)容
技術(shù)流程
樣品與實驗結(jié)果
實驗結(jié)果示例